MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 5463

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018688	TCA	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702535
2	NC_018688	TTTTA	2	10	316	325	20 %	80 %	0 %	0 %	407702536
3	NC_018688	CACTTT	2	12	326	337	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407702536
4	NC_018688	TTCA	2	8	357	364	25 %	50 %	0 %	25 %	407702536
5	NC_018688	GTCA	2	8	414	421	25 %	25 %	25 %	25 %	407702536
6	NC_018688	T	6	6	451	456	0 %	100 %	0 %	0 %	407702536
7	NC_018688	ATA	2	6	465	470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702536
8	NC_018688	AT	4	8	482	489	50 %	50 %	0 %	0 %	407702536
9	NC_018688	TC	3	6	504	509	0 %	50 %	0 %	50 %	407702536
10	NC_018688	GTG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702536
11	NC_018688	TCT	2	6	544	549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702536
12	NC_018688	TAAAAC	2	12	629	640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407702536
13	NC_018688	GTT	3	9	709	717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702536
14	NC_018688	CCA	2	6	768	773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702536
15	NC_018688	T	6	6	777	782	0 %	100 %	0 %	0 %	407702536
16	NC_018688	ATA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702536
17	NC_018688	CCA	2	6	829	834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702536
18	NC_018688	TTC	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702536
19	NC_018688	CTT	2	6	986	991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702536
20	NC_018688	TTG	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702536
21	NC_018688	ATT	2	6	1050	1055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702536
22	NC_018688	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702536
23	NC_018688	ATT	2	6	1194	1199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702536
24	NC_018688	AT	3	6	1217	1222	50 %	50 %	0 %	0 %	407702536
25	NC_018688	ATA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702536
26	NC_018688	GAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702536
27	NC_018688	A	6	6	1284	1289	100 %	0 %	0 %	0 %	407702536
28	NC_018688	TTG	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702536
29	NC_018688	ATT	2	6	1338	1343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702536
30	NC_018688	CTA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702536
31	NC_018688	TTTTTA	2	12	1384	1395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702536
32	NC_018688	TTCCAT	2	12	1771	1782	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407702537
33	NC_018688	TCCTTT	2	12	1847	1858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
34	NC_018688	TCTTTT	3	18	1859	1876	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702537
35	NC_018688	GTTT	2	8	1889	1896	0 %	75 %	25 %	0 %	407702537
36	NC_018688	T	6	6	1915	1920	0 %	100 %	0 %	0 %	407702537
37	NC_018688	TTGAAG	2	12	1938	1949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702537
38	NC_018688	CTT	2	6	1968	1973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
39	NC_018688	TTC	2	6	2071	2076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
40	NC_018688	TTC	2	6	2119	2124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
41	NC_018688	CTTTT	2	10	2188	2197	0 %	80 %	0 %	20 %	407702537
42	NC_018688	TTG	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702537
43	NC_018688	TA	3	6	2259	2264	50 %	50 %	0 %	0 %	407702537
44	NC_018688	CTT	2	6	2271	2276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
45	NC_018688	ACA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702537
46	NC_018688	AAT	2	6	2553	2558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702537
47	NC_018688	CATC	2	8	2577	2584	25 %	25 %	0 %	50 %	407702537
48	NC_018688	TCA	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702537
49	NC_018688	TCTA	2	8	2869	2876	25 %	50 %	0 %	25 %	407702537
50	NC_018688	T	6	6	2985	2990	0 %	100 %	0 %	0 %	407702537
51	NC_018688	TTTTCG	2	12	3032	3043	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407702537
52	NC_018688	TGC	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702537
53	NC_018688	CAA	2	6	3262	3267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702537
54	NC_018688	T	7	7	3272	3278	0 %	100 %	0 %	0 %	407702537
55	NC_018688	ATTT	2	8	3325	3332	25 %	75 %	0 %	0 %	407702537
56	NC_018688	GT	3	6	3351	3356	0 %	50 %	50 %	0 %	407702537
57	NC_018688	CTT	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
58	NC_018688	TAA	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702537
59	NC_018688	TCC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702537
60	NC_018688	AAG	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702537
61	NC_018688	CTG	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702537
62	NC_018688	GAA	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702537
63	NC_018688	TAAC	2	8	3665	3672	50 %	25 %	0 %	25 %	407702537
64	NC_018688	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702537
65	NC_018688	T	7	7	3722	3728	0 %	100 %	0 %	0 %	407702537
66	NC_018688	GTTT	2	8	3829	3836	0 %	75 %	25 %	0 %	407702537
67	NC_018688	T	6	6	3913	3918	0 %	100 %	0 %	0 %	407702537
68	NC_018688	TTTC	2	8	4041	4048	0 %	75 %	0 %	25 %	407702537
69	NC_018688	AAAAG	2	10	4051	4060	80 %	0 %	20 %	0 %	407702537
70	NC_018688	T	6	6	4194	4199	0 %	100 %	0 %	0 %	407702537
71	NC_018688	T	6	6	4205	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	407702537
72	NC_018688	CTT	2	6	4227	4232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
73	NC_018688	TCT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
74	NC_018688	TCT	2	6	4287	4292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702538
75	NC_018688	TCC	2	6	4320	4325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702538
76	NC_018688	TCT	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702538
77	NC_018688	TTC	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702538
78	NC_018688	TTC	2	6	4466	4471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702538
79	NC_018688	TAA	2	6	4513	4518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702538
80	NC_018688	ATA	2	6	4543	4548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702538
81	NC_018688	CTT	2	6	4670	4675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702539
82	NC_018688	TAA	2	6	4715	4720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702539
83	NC_018688	TAA	2	6	4755	4760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702539
84	NC_018688	T	6	6	4846	4851	0 %	100 %	0 %	0 %	407702539
85	NC_018688	ATT	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702539
86	NC_018688	T	6	6	5018	5023	0 %	100 %	0 %	0 %	407702539
87	NC_018688	TTTCAT	2	12	5045	5056	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702540
88	NC_018688	GTA	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702540
89	NC_018688	TTC	2	6	5095	5100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
90	NC_018688	T	6	6	5193	5198	0 %	100 %	0 %	0 %	407702540
91	NC_018688	TGA	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702540
92	NC_018688	CTT	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
93	NC_018688	CTT	2	6	5342	5347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
94	NC_018688	CTT	2	6	5360	5365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
95	NC_018688	T	6	6	5397	5402	0 %	100 %	0 %	0 %	407702540
96	NC_018688	ATG	3	9	5403	5411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702540
97	NC_018688	AT	3	6	5416	5421	50 %	50 %	0 %	0 %	407702540
98	NC_018688	TCA	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702540
99	NC_018688	ATTGT	2	10	5461	5470	20 %	60 %	20 %	0 %	407702540
100	NC_018688	T	6	6	5571	5576	0 %	100 %	0 %	0 %	407702540
101	NC_018688	ATT	2	6	5589	5594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702540
102	NC_018688	TTTGTT	2	12	5612	5623	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407702540
103	NC_018688	ATT	2	6	5643	5648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702540
104	NC_018688	TC	3	6	5701	5706	0 %	50 %	0 %	50 %	407702540
105	NC_018688	ATGAAT	2	12	5733	5744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702540
106	NC_018688	AATG	2	8	5759	5766	50 %	25 %	25 %	0 %	407702540
107	NC_018688	CAGA	2	8	5776	5783	50 %	0 %	25 %	25 %	407702540
108	NC_018688	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	407702540
109	NC_018688	T	6	6	5804	5809	0 %	100 %	0 %	0 %	407702540
110	NC_018688	T	7	7	5848	5854	0 %	100 %	0 %	0 %	407702540
111	NC_018688	TGTTTT	2	12	5862	5873	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407702540
112	NC_018688	TCA	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702540
113	NC_018688	AT	3	6	6052	6057	50 %	50 %	0 %	0 %	407702540
114	NC_018688	CTTCA	2	10	6090	6099	20 %	40 %	0 %	40 %	407702540
115	NC_018688	CTT	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
116	NC_018688	ACA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702540
117	NC_018688	GAT	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702540
118	NC_018688	CAT	3	9	6241	6249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702541
119	NC_018688	TCAT	2	8	6260	6267	25 %	50 %	0 %	25 %	407702541
120	NC_018688	T	7	7	6267	6273	0 %	100 %	0 %	0 %	407702541
121	NC_018688	CT	3	6	6289	6294	0 %	50 %	0 %	50 %	407702541
122	NC_018688	A	6	6	6359	6364	100 %	0 %	0 %	0 %	407702541
123	NC_018688	GCC	2	6	6365	6370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407702541
124	NC_018688	ATT	2	6	6377	6382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702541
125	NC_018688	CTTT	2	8	6411	6418	0 %	75 %	0 %	25 %	407702541
126	NC_018688	T	6	6	6416	6421	0 %	100 %	0 %	0 %	407702541
127	NC_018688	TCA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702541
128	NC_018688	T	6	6	6436	6441	0 %	100 %	0 %	0 %	407702541
129	NC_018688	CCA	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702541
130	NC_018688	AAGAA	2	10	6600	6609	80 %	0 %	20 %	0 %	407702541
131	NC_018688	T	6	6	6735	6740	0 %	100 %	0 %	0 %	407702542
132	NC_018688	TTA	2	6	6747	6752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702542
133	NC_018688	T	6	6	6776	6781	0 %	100 %	0 %	0 %	407702542
134	NC_018688	T	6	6	6799	6804	0 %	100 %	0 %	0 %	407702542
135	NC_018688	TGA	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702542
136	NC_018688	TTTTA	2	10	6842	6851	20 %	80 %	0 %	0 %	407702542
137	NC_018688	T	6	6	6886	6891	0 %	100 %	0 %	0 %	407702542
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269	NC_018688	T	6	6	13979	13984	0 %	100 %	0 %	0 %	407702547
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399	NC_018688	GAA	2	6	18915	18920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702552
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